黄旗寨镇其下属村有： 黄旗寨村民委员会、 小寨子村民委员会、 大寨子村民委员会、 肥地沟村民委员会、 谢家沟村民委员会、 增寨村民委员会、 吴家岭村民委员会、 兰旗寨村民委员会、 龙砬沟村民委员会、 上顶子村民委员会 共10个行政村。