飞云镇其下属村有： 南庄头村民委员会、 闫崖头村民委员会、 老庄村民委员会、 坡头村民委员会、 南峪村民委员会、 元朝村民委员会、 东高寺村民委员会、 飞云村民委员会、 西高寺村民委员会、 毛家村村民委员会、 岸门村民委员会 共11个行政村。